Hlavní nevýhodou hotových řešení je obtížnost doplnění o vlastní funkce.
Doplnění bývá často dražší, než cena licence na celé řešení.
Navíc komplikuje údržbu a upgrade původního řešení, protože upgrade většiny systémů přemaže drahou zákaznickou úpravu.
Jsou tedy systémy – v redakčních např. WordPress – který za jistých podmínek umožňuje upgrade hlavního systému při zachování uživatelských úprav.